Sredinom XVI. st. izvorno romanička crkva i samostan doživljavaju temeljite preinake u prijelaznom gotičko-renesansnom stilu. Tijekom baroka dodani su zapadnom pročelju portal i prozori. Za vrijeme Republike, u samostanu su boravili dubrovački poklisari pred odnošenje godišnjeg danka kojim se plaćao mir carigrskoj Porti. Početkom XIX. stoljeća, nakon pada republike, samostan se ukida, dok je crkva još uvijek u funkciji.